Τον Μάρτιο του 2006 ξεκίνησε ένα πρόγραμμα καθαρισμού των γλυπτών από τους ατμοσφαιρικούς ρύπους, με την ίδια μεθοδολογία που χρησιμοποιήθηκε στον καθαρισμό της δυτικής ζωφόρου του Παρθενώνα από την Υπηρεσία Συντήρησης Μνημείων Ακροπόλεως (ΥΣΜΑ), τα έτη 2002 – 2005.
Το σύστημα που χρησιμοποιείται έχει αναπτυχθεί ειδικά για τα γλυπτά της Ακρόπολης, από το Ινστιτούτο Ηλεκτρονικής Δομής και Λέιζερ του Ιδρύματος Τεχνολογίας και Έρευνας (ΙΤΕ).
Πρόκειται για ένα Q-switchedNd:YAG σύστημα λέιζερ, με εκπομπή στο βασικό μήκος κύματος (1064 nm) και στην 3η αρμονική (355 nm), με δυνατότητα λειτουργίας στο καθένα μήκος κύματος ανεξάρτητα ή ταυτόχρονα και στα δύο μαζί.
Η δυνατότητα ρύθμισης των αναλογιών, μεταξύ των δύο ενεργειών, οδηγεί σε ασφαλή απομάκρυνση των επικαθήσεων, χωρίς αλλοιώσεις των αρχαίων επιφανειών. Μέχρι σήμερα έχει πραγματοποιηθεί καθαρισμός σε 56 γλυπτά και θραύσματα των συλλογών του Μουσείου.
