Ο Σταύρος Θεοδωράκης με μήνυμά του αναφέρθηκε στον θάνατο του Μανώλη Κοντοπυράκη:
Για την πρόωρη απώλεια του συμπατριώτη μου Μανώλη Κοντοπυράκη εκφράζω τη βαθιά μου λύπη. Η Κρήτη θα τον θυμάται για την προσφορά του στην επιστήμη των μαθηματικών και θα τον ευγνωμονεί για την ανάδειξη μεταξύ πολλών και Κρητών επιστημόνων.