Η Χρυσή Αυγή αύξησε σημαντικά τα ποσοστά της στην Κρήτη καταγράφοντας άνοδο 1,3% σε σχέση με τις εκλογές του Ιανουαρίου και φθάνοντας στο 4,5%. Πάραυτα, το νησί έδωσε από τα χαμηλότερα ποσοστά της στην Ελλάδα ενώ υπήρχαν και περιοχές που δεν έδωσαν ούτε μία ψήφο στη Χρυσή Αυγή. Πέραν των Ανωγείων που όπως και στις εκλογές του Ιανουαρίου ουδείς ψήφισε Χρυσή Αυγή, υπάρχουν και άλλα χωριά και περιοχές ή εκλογικά τμήματα που οι πολίτες δεν επέλεξαν τη Χρυσή Αυγή.
Στα Χανιά τα τμήματα που δεν ψήφισαν Χρυσή Αυγή είναι τα εξής: 6ο Μαχαιρών Αποκόρωνα, 38ο Μελιδονίου Αποκόρωνα, 137ο Σέμπρωνα Πλατανιά και166ο Σκαλωτής Σφακίων
Στο Ρέθυμνο πέραν των εκλογικών τμημάτων του δήμου Ανωγείων Χρυσή Αυγή δεν ψήφισαν τα εξής τμήματα: 7ο Δριμίσκου, 20ο Αγίου Βασιλείου, 22ο Αγίου Ιωάννη Καλής Συκιάς, 36ο Λαμπιωτών, 53ο Μέρωνα, 65ο Αγίου Μάμαντος, Αβδελλά, 68ο Καλανδαρέ, 105ο Αξουλιβάδα, 112ο Έρφοι
Στο Ηράκλειο αγνόησαν την Χρυσή Αυγή τα παρακάτω τμήματα: 54ο Καλάμι Βιάννου, 357ο Καμάρι Μαλεβιζίου, 358ο Καμαριώτη Μαλεβιζίου, 398ο Πολυθέας Μινώα Πεδιάδας, 428ο Πέρι Φαιστού, 470ο στα Αϊτάνια
Ενώ τέλος στο Λασίθι Χρυσή Αυγή δεν ψήφισαν τα τμήματα: 30ο στη Λούμα δήμου Αγίου Νικολάου, 78ο στα Γδόχια Ιεράπετρας, Οροπέδιο Λασιθίου, 107ο στο Κάτω Μετόχι, 109ο Μαρμακέτω, 132ο Λάστρο Σητείας, 139ο Ρούσσες Εκκλησιές