Η Χρυσή Αυγή αύξησε σημαντικά τα ποσοστά της στην Κρήτη καταγράφοντας άνοδο 1,3% σε σχέση με τις εκλογές του Ιανουαρίου και φθάνοντας στο 4,5%. Πάραυτα, το νησί έδωσε από τα χαμηλότερα ποσοστά της στην Ελλάδα ενώ υπήρχαν και περιοχές που δεν έδωσαν ούτε μία ψήφο στη Χρυσή Αυγή. Πέραν των Ανωγείων που όπως και στις εκλογές του Ιανουαρίου ουδείς ψήφισε Χρυσή Αυγή, υπάρχουν και άλλα χωριά και περιοχές ή εκλογικά τμήματα που οι πολίτες δεν επέλεξαν τη Χρυσή Αυγή.

Στα Χανιά τα τμήματα που δεν ψήφισαν Χρυσή Αυγή είναι τα εξής: 6^ο Μαχαιρών Αποκόρωνα, 38^ο  Μελιδονίου Αποκόρωνα, 137^ο Σέμπρωνα Πλατανιά και166^ο Σκαλωτής Σφακίων

Στο Ρέθυμνο πέραν των εκλογικών τμημάτων του δήμου Ανωγείων Χρυσή Αυγή δεν ψήφισαν τα εξής τμήματα: 7^ο Δριμίσκου, 20^ο Αγίου Βασιλείου, 22^ο Αγίου Ιωάννη Καλής Συκιάς, 36^ο Λαμπιωτών, 53^ο Μέρωνα, 65^ο Αγίου Μάμαντος, Αβδελλά, 68^ο Καλανδαρέ, 105^ο Αξουλιβάδα, 112^ο  Έρφοι

Στο Ηράκλειο αγνόησαν την Χρυσή Αυγή τα παρακάτω τμήματα: 54^ο Καλάμι Βιάννου, 357^ο Καμάρι Μαλεβιζίου, 358^ο Καμαριώτη Μαλεβιζίου, 398^ο Πολυθέας Μινώα Πεδιάδας, 428^ο Πέρι Φαιστού, 470^ο στα Αϊτάνια

Ενώ τέλος στο Λασίθι Χρυσή Αυγή δεν ψήφισαν τα τμήματα: 30^ο στη Λούμα δήμου Αγίου Νικολάου, 78^ο στα Γδόχια Ιεράπετρας, Οροπέδιο Λασιθίου, 107^ο στο Κάτω Μετόχι, 109^ο Μαρμακέτω, 132^ο Λάστρο Σητείας, 139^ο Ρούσσες Εκκλησιές