Η Περιφέρεια Κρήτης παρουσιάζει σημαντικές ιδιαιτερότητες που καθιστούν αδύνατη την κατάργηση των Στρατιωτικών Δικαστηρίων του νησιού και την ενσωμάτωσή τους στα αντίστοιχα Αθηναϊκά Δικαστήρια. Η προσφορά Στρατοδικείου, Ναυτοδικείου και Αεροδικείου που εδρεύουν σήμερα στα Χανιά είναι πολύ σημαντική τόσο για την απονομή δικαιοσύνης, όσο και για την εξυπηρέτηση των εμπλεκόμενων σε αυτά, ενώ, η ενδεχόμενη κατάργησή τους θα προκαλέσει αποδυνάμωση του Νομού και παράλληλα θα αποτελέσει τροχοπέδη στην απονομή της στρατιωτικής δικαιοσύνης στην Κρήτη.
Αυτό σημειώνει μεταξύ άλλων στη σχετική ερώτηση που κατέθεσε στον Υπουργό Εθνικής Άμυνας Πάνο Μπεγλίτη, ο βουλευτής Χανίων του ΠΑΣΟΚ Σήφης Βαλυράκης επισημαίνοντας ότι η κατάργηση των στρατιωτικών Δικαστηρίων δεν θα πετύχει εξοικονόμηση πόρων αλλά αντίθετα, θα καταστεί πολύ επιζήμια.